动物变异在第二季进入第二阶段，全世界遇到的风险也进一步扩大。它们逐渐攻击人类的基础设施，制造致命的自然环境，试图使地球成为一个不适合居住的星体。在2×01《TheDayOfTheBeast》和2×02《Caraquet》其中，主角精英团队自信地拯救了Jamie和这只带有关键基因的美洲豹，这些都是完成这个小动物困境的关键因素。另外，一个令人惊讶的基因变异危及了主角团队中某人的生命。本季度，JoshSalatin扮演了Jamie遇到的路人Logan，他对她隐瞒了一个风险的真相。在动物变异过程中，AlyssaDiaz扮演了一个国防组织的成员Dariela，他们发现了一个奇怪而复杂的新情况。作为美国国防部部长AllisonShaw，JoanneKelly迫切需要找出处理小动物灾难的计划，并且她与Mitch有亲属关系。