在过去，一个快速发展的先进种族Ancient以地球为工业基地。几百万年前，他们离开地球去了一个省，只在南极留下了一个前哨站。在JackONeill将军使用前哨站的Ancient武器装备解决Goauld战舰前往进攻区域后，世界各国共同成立了南极联盟，共同努力研究前哨站的Ancient高科技，促进国际交流和和平。他们看到了Ancient离开地球后玩的地方——飞马星球，这是一个研究课题。因此，为了探索被淹没的历史和未知的世界，世界各国都成立了亚特兰蒂斯冒险精英团队，并根据星际之门到达了几百万年前从地球飞走的亚特兰蒂斯城。但是遗憾的是，地球人来了，惊醒了一群执政飞马星球的怪物。——Wraith，他们技术先进，身体强壮，性格粗鲁暴虐，不谈忠诚，而且以人为家畜，吸进生命。10,000年前，他们击败了Ancient，并促使它逃往地球，而且检查组还发现了一个令人惊讶的客观事实，Wraith是Ancient实验时代的产物！亚特兰蒂斯的分队为了抵抗强大的Wraith，不得不探索飞马星球的星体，联系天马的土著人，试图找到抵抗Wraith的方法，经历了一次又一次的危险之旅。